사이클로덱스트린은 세종류가 있습니다 : 알파-, 베타-, 감마-사이클로덱스트린이 있습니다. 이들은 각각 6개, 7개, 8개의 글루코스 유닛으로 구성되어 있습니다. 6개의 글루코스로 이루어진 알파-사이클로덱스트린은 가장 작은 링구조를 형성하므로 콜레스테롤과 효과적으로 상호작용하여 수용화할 수 없습니다. 베타- 및 감마-사이클로덱스트린은 콜레스테롤과 상호작용이 가능하며 따라서 콜레스테롤 대사 조절제로써 작용합니다. 현재 베타-사이클로덱스트린의 유도체인 히드록시프로필-베타-사이클로덱스트린(HPβCD)은 임상시험에서 사용되는 유일한 콜레스테롤 대사 조절제입니다. 이 유도체는 베타-사이클로덱스트린에 비하여 수용성이 높고 세포독성을 덜 일으키는 성질을 갖고 있습니다. 현재 히드록시프로필-베타-사이클로덱스트린은 니만피크 C형, 알츠하이머병에, 만성신장질환에, 동맥경화증에 대하여 임상시험 중입니다.